對二倍體生物來說，雖然兩個等位基因的表達調控對發(fā)育至關重要，而且與一些疾病相關，但是現(xiàn)有的研究表明，諸多基因表現(xiàn)為單等位基因高表達，這包括隨機單等位基因高表達、印記基因和等位基因特異的表達。其中，等位基因特異的甲基化是等位基因特異表達產生的重要原因之一。然而，現(xiàn)有的研究主要集中于 DNA 層面。眾所周知，RNA 在轉錄和翻譯過程中發(fā)揮了承前啟后的作用，各種各樣的 RNA 修飾相繼被發(fā)現(xiàn)報道，但是生物體內在 RNA 層面的修飾是否表現(xiàn)為等位基因特異的修飾，還沒有相關的研究。

RNA 編輯是 RNA 水平一種常見的修飾，是增加基因轉錄和功能多樣性的重要形式。中國科學院昆明動物研究所研究員張亞平領導的團隊研究了人類和小鼠各種組織中等位基因特異的 RNA 編輯情況。在人中鑒定出 315 個等位基因特異的 RNA 編輯位點，且這些位點在不同組織中有相當比例的重疊。同時，利用遠源雜交的小鼠，鑒定到 184 個等位基因特異的 RNA 編輯位點，并發(fā)現(xiàn)在不同的雜交組合中有相當比例的重疊，這提示鑒定方法是可信的，并證明等位基因特異的 RNA 編輯是廣泛存在的。有意思的是，在鑒定的等位基因特異的 RNA 編輯位點中有部分位點引起了氨基酸的改變，然而，與之臨近的 SNP 卻為同義突變。細胞水平的突變實驗揭示這些同義突變的位點會影響 RNA 編輯的編輯效率，也就是說，同義突變的 SNP 會導致引起氨基酸改變的 RNA 編輯表現(xiàn)為等位基因特異的修飾。進一步的 SHAPE 實驗揭示，SNP 通過影響 RNA 二級結構從而產生等位基因特異的 RNA 編輯。該工作為等位基因特異的 RNA 編輯研究提供了一個成功的范例，也為解釋和疾病以及性狀改變相關的同義突變提供了新的思路。

該研究工作以 Genome wide analyses uncover allele-specific RNA editing in human and mouse 為題，在線發(fā)表在 Nucleic Acids Research 上。昆明動物所博士周中銀、齊魯工業(yè)大學博士胡岳、西安理工大學博士李愛民、云南大學碩士研究生李應菊和教授趙卉為文章的共同第一作者，張亞平為文章的通訊作者。該工作的 SHAPE 實驗在中科院生物物理研究所研究員秦燕實驗室完成。該工作得到了農業(yè)部轉基因專項和國家自然科學基金委員會的支持。

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細胞實驗證實 SNP 會引起等位基因特異的 RNA 編輯