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區(qū)塊鏈技術(shù)與基因測(cè)序聯(lián)手,進(jìn)軍生命數(shù)據(jù)科學(xué)新領(lǐng)域

發(fā)布時(shí)間:2018-06-15 06:00 類(lèi)別:行業(yè)信息 標(biāo)簽: 來(lái)源:生物360 作者:藥明康德AI / 201

上個(gè)月,由哈佛醫(yī)學(xué)院遺傳學(xué)家 George Church 博士作為聯(lián)合創(chuàng)始人創(chuàng)立的公司 Nebula Genomics 與位于香港的 Longenesis 公司簽署了合作協(xié)議。Longenesis 是由藥明康德投資的 Insilico Medicine 與全球最大的區(qū)塊鏈技術(shù)綜合服務(wù)公司 Bitfury 合作創(chuàng)立的企業(yè),致力于創(chuàng)造“生命數(shù)據(jù)經(jīng)濟(jì)學(xué)”這一新領(lǐng)域。

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▲人體生命數(shù)據(jù)經(jīng)濟(jì)研發(fā)合作負(fù)責(zé)人,從左到右依次是 Alex Zhavoronkov 博士 (Insilico Medicine/Longenesis),Dennis Grishin(Nebula Genomics/ 哈佛大學(xué)),George Church 教授(Nebula Genomics/ 哈佛大學(xué))

該計(jì)劃將應(yīng)用人工智能和區(qū)塊鏈技術(shù),為個(gè)人和生物銀行構(gòu)建一個(gè)安全平臺(tái),以允許用戶存儲(chǔ)、管理、控制和銷(xiāo)售對(duì)他們基因組、實(shí)驗(yàn)室測(cè)試結(jié)果以及其他健康數(shù)據(jù)的使用權(quán)。為了建立這個(gè)數(shù)據(jù)交易市場(chǎng),他們將在這些數(shù)據(jù)價(jià)值的基礎(chǔ)上,發(fā)布一套全新的加密貨幣。

“舉例來(lái)說(shuō),每個(gè)人都將可以使用加密貨幣,在我們的平臺(tái)上購(gòu)買(mǎi)測(cè)序服務(wù),”Nebula Genomics 首席安全官兼聯(lián)合創(chuàng)始人 Dennis Grishin 解釋說(shuō):“在稍后的階段,我們希望我們的平臺(tái)能夠支持第三方應(yīng)用程序,從而向那些尚未命名的新型網(wǎng)絡(luò)用戶進(jìn)行推廣。”

Grishin 認(rèn)為,基因測(cè)序和分析,乃至于精準(zhǔn)醫(yī)學(xué),仍然沒(méi)有得到充分利用,而此次合作恰好可以彌補(bǔ)這一不足!翱傮w來(lái)講,無(wú)論是基因分型,還是基因測(cè)序,這些基因測(cè)試的方式都沒(méi)有真正發(fā)展起來(lái),這也是 Church 教授十多年來(lái)一直在試圖推廣的東西,”Grishin 表示:“我們的愿景是,每個(gè)人都可以對(duì)自己的個(gè)人基因組進(jìn)行測(cè)序。我們不止能像 Ancestry 公司那樣,從基因組里找到有趣的族譜信息,同時(shí)對(duì)基因組的詳細(xì)分析對(duì)個(gè)人的健康也非常有幫助。”

長(zhǎng)期以來(lái),Church 博士一直相信基因組學(xué)會(huì)變成一種常規(guī)手段,并且隨著測(cè)序基因組價(jià)格的下降,這一方法一定會(huì)在患者群中大受歡迎!皩(shí)際上,除了價(jià)格下降之外,人們對(duì)基因組測(cè)序還需要保持積極的態(tài)度,”Grishin 說(shuō):“這就是我們想盡力和 Nebula Genomics 共同完成的目標(biāo)——使人們能夠從共享基因組數(shù)據(jù)中獲益!

Insilico Medicine 首席執(zhí)行官兼 Longenesis 首席首席科學(xué)官 Alex Zhavoronkov 博士表示,精準(zhǔn)人工智能所需的數(shù)據(jù)遠(yuǎn)比現(xiàn)有的數(shù)據(jù)多得多!叭缃竦娜斯ぶ悄苎芯啃枰獡碛袛(shù)百萬(wàn)個(gè)數(shù)據(jù)集,而不是現(xiàn)有的幾千個(gè),只有讓提供數(shù)據(jù)的人們從中獲益,我們對(duì)數(shù)據(jù)的渴求才能得到滿足,” Zhavoronkov 博士說(shuō):“為了實(shí)現(xiàn)這一點(diǎn),我們需要讓數(shù)據(jù)提供者們獲得有用的資源,同時(shí)可能需要向他們支付一定的費(fèi)用!

然而 Grishin 表示,一項(xiàng) Nebula Genomics 的內(nèi)部研究發(fā)現(xiàn),人們?cè)絹?lái)越擔(dān)心他們基因組數(shù)據(jù)的隱私安全問(wèn)題,其中尤其擔(dān)心他們的雇主和保險(xiǎn)公司有可能會(huì)因?yàn)樽约壕哂幸恍┨囟膊〉倪z傳傾向,而對(duì)自己產(chǎn)生歧視。實(shí)際上在美國(guó),遺傳信息非歧視法(Genetic Information Nondiscrimination Act)已經(jīng)出臺(tái)了相關(guān)的規(guī)定,保險(xiǎn)公司或雇主不得根據(jù)個(gè)人的遺傳風(fēng)險(xiǎn)因素進(jìn)行醫(yī)保的疾病覆蓋或就業(yè)的決策。

Grishin 說(shuō):“Nebula Genomics 盡力為基因組數(shù)據(jù)設(shè)立一個(gè)更高的保護(hù)標(biāo)準(zhǔn)。實(shí)質(zhì)上,和其他公司的商業(yè)模式不同的是,我們并不希望擁有用戶的數(shù)據(jù)。反之,我們只是讓人們保持自己數(shù)據(jù)的所有權(quán),并可以自主決定誰(shuí)可以訪問(wèn)他們的數(shù)據(jù)。當(dāng)他們想分享數(shù)據(jù)時(shí),我們保證他們可以以一種非常安全和透明的方式來(lái)實(shí)現(xiàn)這一點(diǎn),從本質(zhì)上確保他們的數(shù)據(jù)不被濫用。”

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▲Nebula Genomics 的技術(shù)平臺(tái)(相關(guān)閱讀:哈佛大牛:用虛擬貨幣購(gòu)買(mǎi)你的基因信息,你愿意嗎?)

隨著 Facebook 爆發(fā)和 Cambridge Analytica 之間的隱私丑聞,以及歐盟今年 5 月 25 日通用數(shù)據(jù)保護(hù)條例的出臺(tái),數(shù)據(jù)隱私的保護(hù)變得更加重要。 Grishin 說(shuō):“某種大型基因組數(shù)據(jù)庫(kù)被類(lèi)似的方式濫用,只是一個(gè)時(shí)間問(wèn)題。而這比 Facebook 事件要糟糕得多。我們正在嘗試構(gòu)建這樣一個(gè)系統(tǒng),以確保這種情況不會(huì)發(fā)生。這實(shí)際上是一個(gè)非常去中心化的系統(tǒng),可以讓每個(gè)人的數(shù)據(jù)得到保護(hù)!

而這就是需要區(qū)塊鏈和 Longenesis 發(fā)揮特長(zhǎng)的地方!皡^(qū)塊鏈?zhǔn)俏覀償?shù)據(jù)所有權(quán)去中心化的理想工具,同時(shí)也允許人們繼續(xù)保持其數(shù)據(jù)所有者的身份。”Grishin 說(shuō)。

Longenesis 是一家區(qū)塊鏈和人工智能公司,是 AI 技術(shù)供應(yīng)公司 Insilico Medicine 與區(qū)塊鏈技術(shù)服務(wù)公司 Bitfury 的合資企業(yè)。Zhavoronkov 博士表示,該合作關(guān)系是在 2017 年摩根大通醫(yī)療會(huì)議上“偶然地”建立起來(lái)的。

“當(dāng)我們?cè)谀Ω笸ㄡt(yī)療大會(huì)上遇到 Bitfury 公司時(shí),他們正在和一些醫(yī)藥公司談?wù)摮醪降难芯宽?xiàng)目,”Zhavoronkov 博士回憶說(shuō)。Insilico Medicine 能夠增加 Bitfury 在生命科學(xué)領(lǐng)域進(jìn)行研究所需的安全性和準(zhǔn)確性。

此外,要想真正建立“生命數(shù)據(jù)經(jīng)濟(jì)學(xué)”的概念,所收集的數(shù)據(jù)集需要更加多樣化。Zhavoronkov 博士說(shuō):“與 Nebula Genomics 的合作關(guān)系使我們能夠查看所有數(shù)據(jù)類(lèi)型,并把這些數(shù)據(jù)類(lèi)型結(jié)合起來(lái)!

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▲傳統(tǒng)模式中(上圖),用戶將自己的唾液交給基因測(cè)序公司,并支付一定的費(fèi)用來(lái)獲取基因測(cè)序結(jié)果,基因測(cè)序公司在經(jīng)用戶同意后,可將這些數(shù)據(jù)出售給醫(yī)藥公司,而無(wú)需支付用戶報(bào)酬。而在 Nebula Genomics 的模式中(下圖),用戶可以獲取完整的基因測(cè)序結(jié)果,而這些數(shù)據(jù)將被放在 Nebula Genomics 的網(wǎng)站上,想要使用這些數(shù)據(jù)的研究人員將需要以加密貨幣的形式向用戶支付一定的報(bào)酬(圖片來(lái)源:Nebula Genomics 官方網(wǎng)站)

之前,表型數(shù)據(jù)、轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組對(duì) Zhavoronkov 博士來(lái)說(shuō)比基因組更有價(jià)值!霸谖覀冮_(kāi)始與 Nebula Genomics 合作之前,我沒(méi)有看到任何基因組數(shù)據(jù)的價(jià)值。”他說(shuō):“但是,所有的數(shù)據(jù)集合在一起,給我們提供了一個(gè)獨(dú)特的機(jī)會(huì),讓我們得以回顧過(guò)去、展望未來(lái),并得到各種標(biāo)記物和靶點(diǎn)的許多洞見(jiàn)。與基因組的信息相結(jié)合后,這些數(shù)據(jù)可以產(chǎn)生真正的價(jià)值! 這些數(shù)據(jù)有助于研究人員找到疾病的根源。

生命數(shù)據(jù)經(jīng)濟(jì)學(xué)這一概念來(lái)自 Insilico Medicine 和 Bitfury 所做的工作中,同時(shí)他們創(chuàng)造了“宏觀數(shù)據(jù)經(jīng)濟(jì)學(xué)”和“微觀數(shù)據(jù)經(jīng)濟(jì)學(xué)” 這兩個(gè)概念。Zhavoronkov 博士解釋說(shuō),微觀數(shù)據(jù)經(jīng)濟(jì)學(xué)是關(guān)于個(gè)人的數(shù)據(jù),而宏觀數(shù)據(jù)經(jīng)濟(jì)學(xué)則側(cè)重于整個(gè)群體。 “我們結(jié)合各種數(shù)據(jù)類(lèi)型來(lái)評(píng)估它們的組合價(jià)值。”

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▲Insilico Medicine 首席執(zhí)行官 Alex Zhavoronkov 博士在 2018 藥明康德全球論壇上分享洞見(jiàn)(相關(guān)閱讀:人工智能如何定義未來(lái)醫(yī)療?| 藥明康德全球論壇實(shí)錄)

“我們希望創(chuàng)造數(shù)據(jù)的時(shí)間價(jià)值。就像一瓶好酒需要漫長(zhǎng)的時(shí)間來(lái)發(fā)酵一樣,如果你一直在堅(jiān)持不懈地收集數(shù)據(jù),它們就會(huì)變得更有價(jià)值。” Zhavoronkov 博士表示。這在癌癥診斷等多種事例中尤其明顯。“這種數(shù)據(jù)類(lèi)型的支出可能會(huì)很大,可能比治療癌癥要多得多!

“例如,我認(rèn)識(shí)的人都沒(méi)有動(dòng)態(tài)數(shù)據(jù),即使是只拿來(lái)自己用,”Zhavoronkov 博士表示。雖然我們可以從 Facebook 或其他社交媒體平臺(tái)上找到一些以前的生活照片, 但這些照片只能算是一些記錄了人們幾個(gè)月內(nèi)的日常生活的數(shù)據(jù)集,并不能體現(xiàn)數(shù)據(jù)的持續(xù)變化!叭绻阌幸粋(gè)包含 1 萬(wàn)個(gè)人和 1 萬(wàn)張照片的數(shù)據(jù)集,然后你又有可以和它相結(jié)合的其他數(shù)據(jù)集,比如說(shuō)驗(yàn)血的數(shù)據(jù)和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。將這些數(shù)據(jù)結(jié)合在一起,這個(gè)數(shù)據(jù)集就會(huì)變得非常有價(jià)值!盳havoronkov 博士說(shuō)。

他還提到了一個(gè)名為質(zhì)量調(diào)整壽命年(Quality-Adjusted Life Years)的概念,而這一指標(biāo)是由不同數(shù)據(jù)點(diǎn)產(chǎn)生的!霸谶@種情況下,你將能夠從醫(yī)療健康的角度來(lái)制定數(shù)據(jù)的價(jià)值,”Zhavoronkov 博士說(shuō)。

Nebula Genomics 和 Longenesis 還希望增加數(shù)據(jù)的“體量?jī)r(jià)值”!霸谠S多人的數(shù)據(jù)集相同的情況下,數(shù)據(jù)數(shù)量達(dá)到某一個(gè)特定點(diǎn)之前,數(shù)據(jù)的價(jià)值都會(huì)增加,但是過(guò)了特定點(diǎn)之后,你的收益就會(huì)開(kāi)始逐漸減少,”Zhavoronkov 博士解釋道!斑@是一個(gè)還沒(méi)有人涉足過(guò)的新領(lǐng)域,需要我們?nèi)ミM(jìn)一步探索!

Grishin 表示,Nebula Genomics 和 Longenesis 的合作將于今年夏天進(jìn)行試點(diǎn)。研究人員將支付用戶用于基因組測(cè)序的費(fèi)用,從而獲取相關(guān)數(shù)據(jù),這也將有助于 Nebula Genomics 測(cè)試其基于區(qū)塊鏈的平臺(tái)。

在未來(lái) 12 個(gè)月內(nèi)的其他工作包括,通過(guò)整合不同的數(shù)據(jù)類(lèi)型,以及與生物銀行合作,來(lái)將數(shù)據(jù)添加到網(wǎng)絡(luò)之中,從而擴(kuò)大這一數(shù)據(jù)平臺(tái)。 Grishin 說(shuō)他希望在一年內(nèi)擁有“數(shù)百萬(wàn)個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)”。

Grishin 說(shuō):“我認(rèn)為許多人沒(méi)有意識(shí)到,未來(lái)的基因組革命將改變?cè)S多人的生活,并創(chuàng)造一個(gè)價(jià)值數(shù)十億美元的新型行業(yè)!彼硎荆@次革命將可以與上世紀(jì) 90 年代互聯(lián)網(wǎng)帶來(lái)的革新相媲美;蚪M數(shù)據(jù)將能夠創(chuàng)建強(qiáng)大的人工智能模型,以真正理解人類(lèi)遺傳學(xué),而醫(yī)療健康領(lǐng)域也將因此得到創(chuàng)新式發(fā)展!

參考資料:

[1] Nebula Genomics, Longenesis Seek to Legitimize 'Life Data Economics'

本文轉(zhuǎn)載自:藥明康德